Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms