Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce1Q9D495 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms