Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms