Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Batf3Q9D275 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms