Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms