Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C1

Rnf115, E3 ubiquitin-protein ligase RNF115, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf115Q9D0C1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf115Q9D0C1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms