Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Raet1eQ9CZQ6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Raet1eQ9CZQ6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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