Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssu72Q9CY97 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssu72Q9CY97 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms