Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms