Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Malsu1Q9CWV0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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