Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pard3bQ9CSB4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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