Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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