Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms