Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp2Q9CQ73 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp2Q9CQ73 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms