Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnaseh2cQ9CQ18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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