Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms