Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atoh8Q99NA2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms