Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms