Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms