Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gins4Q99LZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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