Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms