Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms