Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TriobpQ99KW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms