Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms