Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Krcc1Q99JT5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms