Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd2Q99JR8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcd2Q99JR8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms