Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pacsin3Q99JB8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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