Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms