Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim11aQ99J19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Smim11aQ99J19 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Smim11aQ99J19 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Smim11aQ99J19 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim11aQ99J19 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Smim11aQ99J19 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim11aQ99J19 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Smim11aQ99J19 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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