Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trps1Q925H1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms