Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms