Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms