Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms