Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms