Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Med28Q920D3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms