Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms