Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms