Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8VDP2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q8VDP2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8VDP2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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