Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ubqln1Q8R317 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln1Q8R317 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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