Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms