Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms