Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ssh3Q8K330 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms