Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6bQ8K2H2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6bQ8K2H2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms