Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FgbQ8K0E8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FgbQ8K0E8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms