Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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