Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh13Q8CEE7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rdh13Q8CEE7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh13Q8CEE7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh13Q8CEE7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh13Q8CEE7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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