Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Lrif1Q8CDD9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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