Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ppfibp1Q8C8U0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms