Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vwc2Q8C8N3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vwc2Q8C8N3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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