Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Usp47Q8BY87 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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